नचिकेता गुरुकुल का सबसे महत्त्वपूर्ण और हृदयस्पर्शी प्रकल्प है – बालिका छात्रवृत्ति एवं सशक्तिकरण योजना (Girls Scholarship & Empowerment Program) वर्तमान में नचिकेता गुरुकुल ने 800 छात्राओं को गोद लेकर उनके शिक्षा, संस्कार और सर्वांगीण विकास का उत्तरदायित्व अपने कंधों पर लिया है । यह केवल आर्थिक सहायता प्रदान करने तक सीमित योजना नहीं है, बल्कि इन कन्याओं के जीवन का संपूर्ण मार्गदर्शन और निर्माण करने का एक महत्त्वपूर्ण प्रयास है ।
इस प्रकल्प के अंतर्गत प्रत्येक छात्रा को न केवल शिक्षा उपलब्ध कराई जाती है, बल्कि उसे योग्यता अनुसार जीवन के प्रत्येक क्षेत्र में आगे बढ़ने हेतु संसाधन, अवसर और मार्गदर्शन भी प्रदान किया जाता है । उनका पोषण केवल पुस्तकीय ज्ञान से नहीं, बल्कि संस्कार, आत्मबल और जीवन मूल्यों से भी किया जाता है, जिससे वे आत्मनिर्भर, आत्मविश्वासी और नेतृत्व करने योग्य बन सकें ।
इस योजना का सबसे महत्त्वपूर्ण हिस्सा है प्रतिभा विकास शिविर (Pratibha Vikas Shivir)। इन शिविरों के माध्यम से गोद ली गई छात्राओं को विभिन्न प्रतियोगिताओं और गतिविधियों का अवसर मिलता है —
इन प्रतियोगिताओं और गतिविधियों के माध्यम से उनका व्यक्तित्व निखरता है, आत्मविश्वास प्रबल होता है और नेतृत्व क्षमता विकसित होती है। वास्तव में प्रतिभा विकास शिविर इन छात्राओं के सर्वांगीण विकास का सशक्त साधन है ।